Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scaf11E9PZM7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms