Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd2E9PZM4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd2E9PZM4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms