Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gcom1E9PZ54 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gcom1E9PZ54 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms