Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

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Length 4,059 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkhd1E9PZ36 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms