Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srp54bE9PXC0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms