Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gimd1E9PW74 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms