Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3002E9PW72 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3002E9PW72 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms