Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim30bE9PVL6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim30bE9PVL6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms