Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc17E9PVB5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc17E9PVB5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms