Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc175E9PVB3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms