Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifit3bE9PV48 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms