Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl3E0CZ16 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl3E0CZ16 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms