Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5286E0CXI6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm5286E0CXI6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms