Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
5430403G16RikD3Z5L4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5430403G16RikD3Z5L4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms