Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms