Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm4871D3Z0W7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm4871D3Z0W7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms