Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SafbD3YXK2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms