Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC048679D3YXE9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC048679D3YXE9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC048679D3YXE9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC048679D3YXE9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC048679D3YXE9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BC048679D3YXE9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC048679D3YXE9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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