Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmf1B9EKI3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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