Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cttnbp2B9EJA2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cttnbp2B9EJA2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms