Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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