Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clip3B9EHT4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms