Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Phf11bB4XVQ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Phf11bB4XVQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms