Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc11B2RXC1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trappc11B2RXC1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc11B2RXC1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms