Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700018F24RikB2RW27 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700018F24RikB2RW27 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms