Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rd3lB2RV38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms