Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usf3B2RUQ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms