Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtprbB2RU80 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms