Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zscan5bB2RTN3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms