Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpb1B2RS76 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpb1B2RS76 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms