Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC035947B2RQY6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms