Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf3B2KF05 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf3B2KF05 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms