Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60cB1B213 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H60cB1B213 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H60cB1B213 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms