Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NhsB1AV60 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NhsB1AV60 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms