Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp36B1AQJ2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp36B1AQJ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms