Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tmem238A9JSM3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms