Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ttll11A4Q9F4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll11A4Q9F4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll11A4Q9F4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll11A4Q9F4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll11A4Q9F4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ttll11A4Q9F4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms