Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc9bA3KGF9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms