Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Btbd35f28A2CFD5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms