Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H2al1jA2BFR3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms