Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rtf1A2AQ19 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rtf1A2AQ19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms