Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmpd1A2AKB4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Frmpd1A2AKB4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms