Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VirmaA2AIV2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VirmaA2AIV2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms