Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ambra1A2AH22 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms