Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms