Protein–RNA interactions for Protein: A2A9R3

Mageb4, Melanoma-associated antigen B4, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mageb4A2A9R3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mageb4A2A9R3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mageb4A2A9R3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms