Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc173A0JLY1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc173A0JLY1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms