Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms