Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms