Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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